Knjižnica Etnografskog muzeja osnovana je 1920. godine. Prve su knjige u knjižnici bile dar tadašnjeg ravnatelja Muzeja Salomona Bergera i kasnijeg ravnatelja Vladimira Tkalčića. Od tada se knjižnični fond povećava kupnjom, darom i razmjenom knjiga. Trenutačni fond broji oko 20000 knjiga i časopisa. Nalaze se tu sva važnija djela s područja etnografije i etnologije, osobito ona tematski vezana uz Hrvatsku, te djela srodnih disciplina, kao što su povijest, povijest umjetnosti, arheologija i književnost. U fondu knjižnice nalaze se vrijedna djela, poput Fortisova “Viaggio in Dalmazia” (Venecija, 1774.), Carrarinog “La Dalmazia descrita” (Zadar, 1846.) i Kraussove “Anthropophyteia” (Leipzig, 1904.).