Videoteka je osnovana sredinom 1990-ih i najnoviji je dokumentacijski fond.
Danas sadržava oko 100 video/DVD zapisa na kojima su uglavnom zabilježene djelatnosti hrvatskih i manjim dijelom europskih muzeja i galerija, i to otvorenja povremenih izložaba ili stalnih postava, arheološka iskopavanja, predavanja, akcije poput obilježavanja Međunarodnog dana muzeja, ali i priče o utemeljiteljima muzeja (o dr. Antunu Baueru), kolekcionarima (dr. Josipu Kovačiću) i stručnim muzejskim djelatnicima.
Premda su zapisi većim dijelom nastali kao rezultat entuzijazma naših muzealaca te presnimavanjem TV priloga i emisija, manji broj njih je realiziran u produkciji samih muzeja koji sve više nastoje korištenjem audio-vizualnih tehnologija dokumentirati svoj rad. Zanimljivo je istaknuti da su neki zapisi nastali kao autorski, režiserski te snimateljski prilozi.
Potkraj 2006. godine pokrenuli smo MUVI 01: muzeji–video–film, jer nam je nedostajalo mjesto gdje će se muzealci, voditelji zbirki filmske građe, zbirki novih medija, voditelji fototeka, filmoteka, profesionalci koji se bave zaštitom audiovizualne građe i proizvodnjom filma, ali i publika susretati, razmjenjivati mišljenja, ideje i razgovarati, možda i o nekim budućim zajedničkim projektima. Stoga smo pozvali muzeje da se predstave izborom svojih filmskih/ video zapisa iz muzejskih ili dokumentacijskih zbirki.
Tijekom tri dana programa imali smo priliku vidjeti 51 film raspoređen unutar više cjelina, dok je trećega dana održano predavanje dr.sc. Mate Kukuljice (Hrvatski državni arhiv / Hrvatska kinoteka) Novine u zaštiti audiovizualnog gradiva.