| Im Museum von Slawonien, das von seiner Gründung an ein komplexes Museum ist, wurde auch naturwissenschaftliches Material aufbewahrt, das mit unterschiedlicher Intensität ins Museum kam. Besonders attraktiv waren die paläontologischen Funde während der archäologischen Ausgrabungen, sowie die Geschenke naturwissenschaftlicher Sammlungen verschiedener Einzelpersonen, unter denen hebt sich die erste größere naturwissenschaftliche Sammlung - genauer gesagt die malakologische Sammlung von Emerik Hilde aus dem Jahr 1898 hervor.
Mit der Zeit gewinnt die Sammlung immer mehr an Bedeutung, so daß es immer notwendiger wird, eine eigenständige Abteilung mit adäquater sachlicher Pflege und Bearbeitung zu gründen. Das Material aber wurde innerhalb verschiedener Abteilungen des Museums aufbewahrt, größtenteils in der archäologischen Abteilung. Im Jahr 1994 wird eine eigenständige Abteilung gegründet, was das hochwertige und systematische Sammlen, Aufbewahren, Bearbeiten und Präsentieren des naturwissenschaftlichen Materials ermöglicht. Das Material der naturwissenschaftlichen Abteilung ist in der: geologisch-paläontologischen Sammlung, Das geologisch-paläontologische Material ist in:
Sammlung unterteilt. Innerhalb der paläozoologischen Sammlung befindet sich:
Die mineralogisch-petrographische Sammlung enthält:
Das zoologische Material ist
Die botanische Sammlung enthält ein
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