Antonija Bauer rođena je u Zagrebu 1913. Njezina obitelj potječe iz Gradišća (Austrija). Otac joj je bio petnaesto dijete u obitelji i živio je u prvo vrijeme u Varaždinu. Najstariji očev brat bio je zagrebački nadbiskup dr. Antun Bauer (istog imena i prezimena kao njezin suprug).
Diplomirala je na Pravnom fakultetu Sveučilišta u Zagrebu, ali nikada nije radila kao pravnica. Godine 1945. upisala je studij povijesti umjetnosti i arheologije na Filozofskom fakultetu u Zagrebu, apsolvirala, ali nije diplomirala.
Do 1952. radila je kao knjižničarka u Gipsoteci. Zajedno sa suprugom A. Bauerom i sa suradnicima izradila je Bibliografiju za povijest umjetnosti i srodne struke, u trideset i tri sveska (čiji se kopije čuvaju u današnjoj Gliptoteci, Likovnom arhivu HAZU i knjižnici MDC-a). Usporedo je sa suprugom A. Bauerom, utemeljiteljem i osnivačem MDC-a, u Gipsoteci radila i poslove povijesničarke umjetnosti te tehničke poslove vezane za Gipsoteku.
Od 1953. zaposlila se kao bibliotekarka na Pravnom fakultetu, doktorirala knjižničarstvo i radila sve do mirovine 1973. godine.
Za MDC je napisala tekst o 60 godina zajedničkoga života i rada s Antunom Bauerom u kojemu govori o podudarnosti njihovih imena i prezimena kao i podudarnosti njihovih profesionalnih interesa što je rezultiralo 60. godišnjim brakom, ali i profesionalnom suradnjom. Antonija Bauer umrla je 26. prosinca. 2003. u 90. godini.

Napomena: podatci preuzeti iz anketnog upitnika, materijala predanih za Personalni arhiv MDC-a i iz intervjua snimljenog 7. lipnja 2002. Razgovor vodila i snimila Jozefina Dautbegović.